日本FBA頭程清關一般包括以下程序：
1. 到達日本機場/港口：貨物從中國運抵日本機場或港口，根據運輸方式不同，會到達相應的地點。
2. 提交進口申請表：到達日本后，需要向日本海關提交進口申請表，海關會根據此申請對貨物進行檢驗、檢查、查驗，進行清關。
3. 提供通關信息：向日本海關提交清關所需資料，包括產地證、商檢證、貨物報關單等特殊貨物證明，接受海關的檢查。
4. 繳納關稅：通過海關檢查后，需要按照貨物對應的稅率繳納關稅。代理商通常會幫助完成納稅手續。
5. 獲得進口許可證：繳納關稅后，獲得進口許可證，可以進行最終交貨。
